Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csf1P07141 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms