Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfrbP05622 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfrbP05622 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms