Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms