Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atf6bO35451 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms