Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf148G3X9R7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms