Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Taf4E9QAP7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Taf4E9QAP7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms