Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms