Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Phf11bB4XVQ1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf11bB4XVQ1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms