Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clrn2B2RVW2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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