Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms