Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NhsB1AV60 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms