Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Phf1Q9Z1B8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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