Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SrfQ9JM73 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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