Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms