Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Mrpl39Q9JKF7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Mrpl39Q9JKF7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Mrpl39Q9JKF7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Mrpl39Q9JKF7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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Mrpl39Q9JKF7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Mrpl39Q9JKF7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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