Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smg9Q9DB90 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Smg9Q9DB90 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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