Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf138rt1Q9D9M9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms