Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q9D2Q3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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