Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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