Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms