Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rdm1Q9CQK3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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