Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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