Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim26Q99PN3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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