Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Brms1Q99N20 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Brms1Q99N20 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms