Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Hdac9Q99N13 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac9Q99N13 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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