Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ms4a4dQ99N05 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms