Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnps1Q99M28 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms