Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp16Q99LG0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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