Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TrabdQ99JY4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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