Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms