Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hecw1Q8K4P8 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms