Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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