Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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