Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pramef8Q8CE24 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms