Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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