Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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