Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms