Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp38Q8BW70 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp38Q8BW70 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp38Q8BW70 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp38Q8BW70 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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