Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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