Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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