Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ttc28Q80XJ3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc28Q80XJ3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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