Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Acsm4Q80W40 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Acsm4Q80W40 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms