Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NischQ80TM9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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