Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
IfnkQ7TSL0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms