Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ubfd1Q78JW9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ubfd1Q78JW9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ubfd1Q78JW9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ubfd1Q78JW9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ubfd1Q78JW9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ubfd1Q78JW9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ubfd1Q78JW9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ubfd1Q78JW9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ubfd1Q78JW9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ubfd1Q78JW9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ubfd1Q78JW9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ubfd1Q78JW9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ubfd1Q78JW9 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms