Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms