Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms