Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms