Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms