Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhocQ62159 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhocQ62159 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms